新型冠状病毒(SARS-CoV-2)

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October 28, 2021

严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2:SARS-CoV-2,以前被世界卫生组织使用是冠状病毒。 2019 年新型冠状病毒病 (2019-nCoV) 以及该病毒引起的疾病开始传播时使用的临时名称是“武汉冠状病毒”或“武汉肺炎”(简体中文:武汉冠状病毒;)。繁体中文:武汉冠状病毒)是一种引起呼吸道感染的传染性病毒。这是 2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 在 2019-2020 年爆发的原因。基因组测序显示,它是一种单链RNA病毒。带有一系列遗传物质,如 mRNA (正链单链RNA病毒)首例疑似病例于2019年12月31日向世界卫生组织报告。首例病例出现在三周前,即公元12月8日。2019 对一名肺炎患者的阳性患者样本进行核酸检测后,对该病毒进行了基因组测序。在 2019-2020 年冠状病毒爆发期间,许多早期病例与出售海鲜和动物的大型市场有关。并且该病毒被认为具有动物来源。这种病毒和其他病毒样本的基因序列比较显示,与SARS(79.5%)和蝙蝠冠状病毒(96%)有相似之处,使其最有可能起源于蝙蝠。5%) 和蝙蝠冠状病毒 (96%),这最有可能起源于蝙蝠。5%) 和蝙蝠冠状病毒 (96%),这最有可能起源于蝙蝠。

发现历史

2019 年 12 月 31 日,世界卫生组织(WHO)办公室收到中国当局正式通报的多起重症肺炎病例。在武汉,它发生在 2019 年 12 月,其感染原因以前从未被发现。截至 2020 年 1 月 3 日,向世界卫生组织报告了 44 例病例。其中重症11例,病情稳定33例。部分患者是华南海鲜批发市场的卖家或贸易商(中文:华南海鲜批发市场;海市场;拼音:Huánán hǎixiān pīfā shìchǎng) 在武汉,负责的政府机构世界卫生组织发言人于 2020 年 1 月 1 日关闭了市场。其当时表示,有可能在市场上找到感染源。尚未发现人与人之间的传播。这一消息引起了全世界的关注。因为它是对公元中国南方发生的非典疫情的倒叙。2002-2003 年,截至 2020 年 1 月 7 日,当时全球感染了 700 多人,中国病毒学家徐建国(中文:徐建国;)。拼音:Xú jiànguó),负责病毒类型鉴定,已宣布病原体为新型冠状病毒。这是对15名患者的血液样本和咽喉分泌物进行检测的结果。这一点在世界卫生组织2020年1月9日和1月13日的官方声明中得到证实。2020年新型冠状病毒的完整基因组序列被记录在NCBI中GenBank 数据库(GenBank 编号 MN908947)。负责病毒类型鉴定的Xújiànguó已宣布病原体为新型冠状病毒。这是对15名患者的血液样本和咽喉分泌物进行检测的结果。这一点在世界卫生组织2020年1月9日和1月13日的官方声明中得到证实。2020年新型冠状病毒的完整基因组序列被记录在NCBI中GenBank 数据库(GenBank 编号 MN908947)。负责病毒类型鉴定的Xújiànguó已宣布病原体为新型冠状病毒。这是对15名患者的血液样本和咽喉分泌物进行检测的结果。这一点在世界卫生组织2020年1月9日和1月13日的官方声明中得到证实。2020年新型冠状病毒的完整基因组序列被记录在NCBI中GenBank 数据库(GenBank 编号 MN908947)。

命名

命名建议以武汉命名该病毒,该病毒最初被确认为未考虑武汉呼吸道冠状病毒 (WRS-CoV)。专家给出的一种可能原因是过去针对每个国家或地区命名病毒时的投诉。 (例如中东呼吸综合征冠状病毒 (MERS-CoV) 病毒数据以武汉海鲜市场肺炎病毒的名称被纳入 NCBI 的分类数据库(与病毒名称和分类无关)。一般来说,病毒的通称是“冠状病毒”、“新型冠状病毒”和“武汉冠状病毒”,而世界卫生组织引入了临时病毒名称“2019-nCoV”。由于担心缺乏官方名称可能导致对非官方名称的偏见使用。根据世界卫生组织 2015 年版国际病毒分类委员会的指导方针。国际病毒分类委员会 (ICTV) 将于 2020 年 2 月 11 日推荐该病毒的正式正式名称。世界卫生组织已将该病毒引起的疾病指定为“COVID-19”,代表“冠状病毒病” 2019”或冠状病毒病同一天(2月11日),国际病毒分类委员会(ICTV)宣布,根据现有计算冠状病毒等级相关性的规则,基于五个相同核酸的序列这种新病毒株的分化来自1945 年 SARS 流行的病毒株2003 年不足以制造一个单独的病毒物种。因此,委员会将 2019-nCoV 确定为与严重急性呼吸系统综合症 (SARS-CoV) 相关的冠状病毒株。

病毒学

系统发育学和分类学

SARS-CoV-2 是一大类被称为冠状病毒的病毒。在选择更具体的名称之前,“nCoV”是用于指代新型冠状病毒的标准术语。其他冠状病毒有引起疾病的能力。从普通感冒到更严重的疾病,如中东呼吸综合征 (MERS) 和严重急性呼吸综合征 (SARS),但之前只有 6 种类型感染人类(229E、NL63、OC43、HKU1、MERS-CoV 和 SARS-CoV)。使 SARS-CoV-2 成为第七种类型,从 SARS-CoV-2 中分离出的武汉虎 1 基因组菌株(基因库编号 MN908947)显示出与从 SARS-CoV-2 中分离出的冠状病毒最大的相似性。当年分析的但是,这种病毒在基因上与严重急性呼吸系统综合症冠状病毒等其他冠状病毒不同。 Beta-CoV B 系的 18 个成员,以及 SARS-CoV(Sarbecovirus 亚属)基因组编号为 18。新冠状病毒的分离和报告包括BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019、BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-04/2020、BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-05/2019、BetaCoV/Wuhan/WIV04/2019 和 BetaCoV/Wuhan/IPBCAMS- WH-01/2019这是由国家疾病控制和预防研究所报告的。中华人民共和国疾病预防控制中心(CCDC;中国:中国疾病预防控制中心,病原生物学研究所和武汉金云潭医院(中文:武汉市金银潭医院),RNA 序列。该病毒的总核苷酸长度为 29,903 个碱基对,由 29、410个碱基对,5'和3'端分别有265个碱基对和228个不可翻译的碱基对。病毒编码区假说分为10个部分,由ORF1ab、7096个碱基长的多聚蛋白、糖蛋白壳组成。( S) 1282个长碱基,蛋白质包膜(E) 75个碱基长,糖蛋白膜(M) 222个长碱基,核衣壳磷蛋白419个长,以及其他5个基因(ORF3a、ORF6、ORF7a、ORF8和ORF10)基因序列对应所有SARS和其他冠状病毒。除了 GenBank 的基因组测序,基因组序列由 GISAID 收集,病毒样本的系统发育分析由 Nextstrain 发表。膜糖蛋白 (M) 长 222 个碱基,核衣壳长 419 个碱基的磷蛋白,以及其他五个基因(ORF3a、ORF6、ORF7a、ORF8 和 ORF10),可对抗 SARS 病毒和所有其他冠状病毒。除了 GenBank 的基因组测序,基因组序列由 GISAID 收集,病毒样本的系统发育分析由 Nextstrain 发表。膜糖蛋白 (M) 长 222 个碱基,核衣壳长 419 个碱基的磷蛋白,以及其他五个基因(ORF3a、ORF6、ORF7a、ORF8 和 ORF10),可对抗 SARS 病毒和所有其他冠状病毒。除了 GenBank 的基因组测序,基因组序列由 GISAID 收集,病毒样本的系统发育分析由 Nextstrain 发表。

亚种

SARS-CoV-2 有数千个亚种。已经提出了几种进化枝系统,Nextstrain 分为五个进化枝(19A、19B、20A、20B 和 20C),其中 GISAID 分为 7 组(L、O、V、S、G、GH、和 GR)在 2020 年末列出了以下重要且经常提到的亚型: Cautionary Subtype 202012/01(Variant of Concern 202012/01)或VOC 202012/01,据信于2020年9月在英国出现。流行病学指标的初步评估表明,该亚型可能更容易接触但没有证据表明这会影响疾病的严重程度或疫苗的功效。该亚型有多个突变。其中之一是病毒多刺蛋白与受体结合的结构域的突变。在 501 位,天冬酰胺转化为酪氨酸 (N501Y)。这种突变可能使病毒与 ACE2 受体结合得更紧密。

生物结构

2015 年 1 月 23 日,病毒基因组的解码导致了一系列与 SARS-CoV-2 刺突(S)受体蛋白(RBD)结合的蛋白质建模实验。 2020 两名中国研究人员认为,刺突蛋白有可能与 SARS(血管紧张素转换酶 2,ACE2)受体结合作为进入细胞的机制。和美国的一个研究反向遗传学的小组。独立证明 ACE2 是一种受体来自病毒 ORF1a 多蛋白的酶 C30 内肽酶 (3CLpro) 被建模用于药物连接实验。Innophore 研究团队制作了两个计算模型。使用 SARS 病毒的蛋白酶进行建模。和中国科学院(中文:中国科学院)已经创建了一个未发表的 2019-nCoV 重组酶蛋白酶的实验结构。此外,密歇根大学的研究人员已经使用 I-TASSER 模拟了所有完整肽的结构 SARS-CoV-2 基因组

接触

中国广东省已确认人传人。根据声明,负责调查疫情的公共卫生委员会主任钟南山(中文:钟南山)。即使在潜伏期也发现了病毒感染。后来的研究结果证实了这一点。但世界卫生组织表示“来自无症状感染者的传播可能不是传播的主要驱动因素。”此时,大多数冠状病毒都是通过密切接触传播的。特别是通过呼吸道来自咳嗽和打喷嚏的飞沫。在大约 6 英尺 (1.8 m) 的距离处。在感染病毒的患者的粪便样本中检测到的病毒 RNA 被评估为基线感染 (R0) 水平在 3 之间。高达 5 意味着有通常每个感染情况有 3 到 5 人被感染。其他研究小组估计的基线感染水平在 1.4 到 3 之间。9 表示未选中时该病毒将导致每次感染 1.4 至 3.9 个新病例。已经确定该病毒可以通过至少四个人的链传播。为防止进一步流行,必须通过适当措施将传播减少多达 60%。先前证实的发病率和死亡率的数量导致死亡率为 2.9% (80/2744)。

病源

怀疑作为食物出售的动物是疾病来源或携带者。首例确诊病例是华南海鲜市场的一名工人。因此,他们不得不接触大量的动物。生鲜市场同样被归咎于 2003 年 SARS 流行的市场被认为是外来病原体的完美孵化器。疫情导致中国暂时禁止野生动物贸易和消费。但也有研究人员指出,华南海鲜市场有足够数量的基因组测序数据,它可能不是病毒人类传播的来源。在对 BC SARS 流行病起源的 17 年研究中,可以绘制出病毒家族突变历史的民族志树。2003年分离出大量类似SARS的蝙蝠冠状病毒并进行基因组测序。发现武汉冠状病毒属于与 SARS 相关的冠状病毒两个基因组序列来自2015年和2017年发表的“中华冠蝙蝠(Rhinolophus sinicus)”与来自“红冠蝙蝠(Rhinolophus affinis)”的第三个样本病毒基因组序列SARS-CoV-2(“RaTG13”)有80%的相似性。 96% 与 SARS-CoV-2 相似。它们与 H3N2 流感病毒 10 年间观察到的突变量相似。RaTG13") 来自“红冠蝙蝠 (Rhinolophus affinis)”,与 SARS-CoV-2 的相似度为 96%。它们与 H3N2 流感病毒 10 年间观察到的突变量相似。RaTG13") 来自“红冠蝙蝠 (Rhinolophus affinis)”,与 SARS-CoV-2 的相似度为 96%。它们与 H3N2 流感病毒 10 年间观察到的突变量相似。

临床病理学

临床表现

据报道,90%的患者有发热、80%的乏力干咳、20%的呼吸急促、15%的呼吸困难,胸部X线片显示双肺征象。这可能导致肺炎、肾衰竭和严重感染导致的死亡。世卫组织总干事谭德塞在 2020 年 1 月 23 日的一份声明中说:四分之一的感染者有严重的症状。许多死者还有其他症状,削弱了他们的免疫系统。例如高血压、糖尿病或冠状动脉疾病 住院时生命体征一般稳定。血液检查的白细胞总数偏低(白细胞减少症),尤其是淋巴细胞偏低。(淋巴细胞减少症)

如何检查

可以使用逆向聚合酶链反应 (RT-PCR)(从痰液、支气管分泌物和粘膜中)直接检测病毒。气管冲洗水 鼻涂片标本采集),适用于疑似肺炎患者且在暴发前 14 天在风险地区。以及与确诊患者有过接触的有症状者。是推荐的方法 直到开发出间接检测方法。(抗体检测)和患者血清采集也是推荐的(截至 2020 年 1 月 26 日)。

治疗研究

由 SARS-CoV-2 病毒引起的疾病已被暂时指定为世界卫生组织的“急性呼吸道疾病 2019-nCoV”。没有经过医学研究标准证实的治疗方法。 (就随机、同行评审临床试验的系统评价而言)此时(2020 年 2 月),治疗的重点是缓解症状。这些包括发烧、干咳和呼吸急促。它已经开始寻找潜在的治疗方法,2020 年 1 月,中国疾病预防控制中心开始测试现有的肺炎治疗方法。确定治疗冠状病毒引起的肺炎的疗效。一月下旬正在检查现有抗逆转录病毒药物的功效。包括蛋白酶抑制剂,例如茚地那韦沙奎那韦和洛匹那韦/利托那韦也是一月下旬开始的。测试先前确定的 RNA 聚合酶抑制剂 Remdesivir、干扰素-β 和单克隆抗体 (mAb)。在可能的情况下,大约在同一时间开始治疗。该项目研究了使用 Sofosbuvir(一种 RNA 依赖性 RNA 聚合酶抑制剂)治疗丙型肝炎的功效。 2020年1月下旬开始,2020年2月2日,泰国有报道称已成功救治一名患者。来自 Rajavithi 医院的 Kriangsak Atipornvanich在曼谷,在公共卫生部的简报会上说,一名来自武汉的 71 岁中国妇女在医生使用抗逆转录病毒药物洛匹那韦和利托那韦治疗后 48 小时检测结果呈阴性。与流感抗病毒药物联合使用由于称为“细胞因子风暴”的严重免疫反应,SARS、流感和 SARS-CoV-2 病毒性肺炎等急性呼吸道疾病被认为会危及生命。

疫苗

2019 冠状病毒疫苗是一种旨在建立针对 COVID-19 病毒的免疫力的疫苗。在 COVID-19 爆发之前的时期包括严重急性呼吸系统综合症 (SARS) 和中东呼吸系统综合症 (MERS) 在内的各种冠状病毒的疫苗开发工作积累了大量有关疫苗结构和功能的知识。这加速了各种冠状病毒疫苗技术的发展,截至2020年初,至2021年1月,已有69种候选疫苗进入治疗研究,其中19种处于I期试验阶段,24种处于1-2期,6 种 II 期和 20 种 III 期疫苗,其中几种 III 期疫苗已显示出对 2021 年 1 月之前 95% 的有症状感染的预防效果,其中至少有一个州卫生监管机构已批准公开注射,其中包括两种 RNA疫苗(Pfizer-BioEntech 的 Tozinameran 和 Moderna 的 mRNA-1273)、基于四种被杀死的 COVID-19 病毒的疫苗(SinoFarm 的 BBIBP-CorV、Bharat Biotech 的 BBV152、Sinovak 的 Coronavac 和 SinoFarm 的 WIBP)、基于病毒载体类型的疫苗(Gam. COVID-Vac 或 Gamaleya 研究所的 Sputnik 5,牛津大学/阿斯利康的 AZD1222 和 Cancino Biologics 的 Ad5-nCoV)和一种多肽疫苗(EpiVacCorona)。排名是给那些有并发症风险的人,比如老年人,以及那些有感染和传播疾病风险的人,比如医疗保健工作者,直到 2021 年 1 月 30 日。世界各地的公共卫生组织报告说,已经接种了 9491 万剂 COVID-19 疫苗。其中产量最大的三个制造商辉瑞、Moderna 和阿斯利康表示,他们今年将能够生产 53 亿剂疫苗。到 2021 年,这可以提供全世界 30 亿人每人服用两剂以预防疾病。但直到 12 月,各国已经预订了 10 多种疫苗,0 亿剂,其中一半是高收入国家,尽管仅占世界人口的 14%。由于到 2020-21 年对疫苗的高需求,被归类为低收入的发展中国家的人们可能不会接种这些制造商的疫苗到 2023 年或 2024 年可用,这使得 Cowax 计划对于普遍提供疫苗至关重要。

流行病学

第一次已知的人类感染发生在 2019 年 12 月上旬。唯一已知的爆发点与华南海鲜市场有关。 12月中旬在中国武汉。这可能从单个受感染的动物开始。该病毒后来传播到中国所有省份。以及亚洲、欧洲、北美洲和大洋洲的二十多个国家。 2017 年 1 月 30 日,中国、德国、泰国、越南、日本和美国确认了人与人之间的传播。2020 年 SARS-CoV-2 病毒爆发已被世界卫生组织 (WHO) 指定为全球卫生紧急事件。迄今为止,大约五分之一的确诊病例处于危急状态。几乎所有中国以外的病例都发生在从武汉来的人身上。或与直接从该地区旅行的人接触。由于 SARS-CoV-2 感染导致的总体死亡率和发病率尚不清楚。这是因为在当前疫情期间,死亡率可能会随着时间的推移而发生变化。并且由于症状较轻的人和没有症状的人未被确诊的人数尚不清楚,初步研究估计死亡率为感染者的 2-3%。世界卫生组织建议死亡率在 3% 左右。截至 2020 年 2 月 3 日(UTC 时间 02:00),该病毒造成的死亡总数为 362。00 UTC),共 362 例。00 UTC),共 362 例。00 UTC),共 362 例。00 UTC),共 362 例。

一开始的事件顺序

据中国当局称,截至 2020 年 1 月 11 日,已记录了 40 例确诊的病毒病例,并在同一天,其中一名 61 岁男性患者死于该病毒。中国境外首例确诊病例于2020年1月13日,为曼谷一名61岁中国女性,2020年1月8日进入武汉,第二例死亡病例为69岁男性患者2020年1月15日,中国境外病例数于2020年1月18日上升至3例(泰国2例,泰国2例)。一个在日本)来自国外确诊病例的数量。流行病学家得出结论,武汉确诊病例数肯定高于官方确诊的41例,专家估计截至1月17日武汉确诊病例数约为1700例。2020年初新加坡和香港的机场正在实施安全措施。来自武汉的旅客将接受检查。特别是对于体温升高,询问肺炎症状的人。泰国、韩国、马来西亚和菲律宾的多个机场也采取了类似的措施。从 2020 年 1 月 18 日起,同样的控制措施将在美国三个主要机场生效。 2017 年 1 月 20 日,旧金山国际机场 (SFO)、洛杉矶国际机场 (LAX) 和纽约肯尼迪国际机场 (JFK)。 到 2020 年,中国当局报告的新增病例急剧增加。 1 月 18 日至 19 日有 139 名新患者。2020年,有些在武汉以外。在深圳和北京。据报道,另一例死于该病毒。并报告韩国首例病例。中国当局已确认该感染可在人与人之间传播。2020年1月21日,2020年1月15日,从武汉返回美国的美国人在西雅图确诊为亚洲以外首例2019-nCoV感染。世界卫生组织 (WHO) 于 2020 年 1 月 22 日召开紧急委员会会议,以澄清冠状病毒的传播是紧急情况。一开始就没有澄清需要在 1 月 23 日再次讨论进一步的行动。2020 在西雅图,世界卫生组织 (WHO) 于 2020 年 1 月 22 日召开了紧急委员会会议,以澄清冠状病毒的传播是国际突发卫生事件。一开始就没有澄清需要在 1 月 23 日再次讨论进一步的行动。2020 在西雅图,世界卫生组织 (WHO) 于 2020 年 1 月 22 日召开了紧急委员会会议,以澄清冠状病毒的传播是国际突发卫生事件。一开始就没有澄清需要在 1 月 23 日再次讨论进一步的行动。

武汉的检疫措施

自 2020 年 1 月 23 日起,所有从武汉出发的火车和航班连接 这座拥有约 900 万人口的城市拥有巴士、地铁和渡轮服务。武汉居民被告知不要离开这座城市。图书馆、博物馆和剧院取消活动和表演。武汉是疫情防控协调中心,截至目前,官方已确诊感染病例500例,死亡病例17例(均在武汉和湖北)。专家估计,截至2020年1月22日,感染人数将在4000人左右,据《中国日报》报道,周四武汉的主要道路将被封锁。公共场所有戴防护口罩的措施。任何在酒店、餐厅、商场不戴口罩的人 公园不得进入该地区。

其他城市的隔离措施

位于武汉以东约 70 公里的拥有 750 万人口的黄冈(中文:黄冈)与公共交通被切断。从当地时间 2020 年 1 月 24 日星期五午夜 (UTC+8) 开始,所有电影院网吧这个城市的中央市场已经关闭。尔州市(中国:鄂州)1月23日火车总站关闭后,共有近2000万人受限制。这是北京现代史上独一无二的盛事。1 月 23 日星期四,中国农历新年庆祝活动在周末宣布。新年两周后,圣地的传统仪式被取消。还有一些景点关门了。第二例确诊后,中国澳门特别行政区。 1月25日至2月8日的元旦庆祝活动也被取消。中国在没有咨询世界卫生组织的情况下实施了检疫措施。世卫组织总干事谭德塞同意这一行动,因为“收集群众是传播的危险因素。”他承诺会提供更明确的旅行建议。周四晚上在日内瓦举行的突发事件委员会听证会结束时。鄂州市后仙桃(中文:仙桃)、碧(中文:赤壁)和利川(中文:利川)等城市的火车也停止运营。

患者人数

SARS-CoV-2 病毒在全球爆发

查看更多

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参考

其他来源

Wikimedia Commons 有与 2019-nCoV 相关的媒体“疾病控制中心(CDC)对 2019-nCoV 的解释”“国家生物技术信息中心(NCBI)2019-nCoV 公开序列列表”“世界卫生组织(WHO)2019 年网站-nCoV "" 2019-nCoV "。美国食品和药物管理局。“新冠病毒”。BMJ。“新型冠状病毒信息中心”。阿尔萨菲尔。“2019-nCoV 资源中心”。兰西特。“2019 新型冠状病毒 (2019-nCoV)”。NEJM。“冠状病毒研究”。威利。“武汉新型冠状病毒(2019-nCOV)传播实时交互式全球地图”。约翰霍普金斯大学。